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廣州賽誠生物科技有限公司
廣州市黃埔區學(xué)大道攬月路廣州企業(yè)孵化器B座402
電話(huà)：020-85625352
手機：18102256923、18102253682
Email：servers@gzscbio.com
Fax：020-85625352
QQ：386244141
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項目名稱(chēng)：ATAC-seq
所屬分類(lèi)：TF（Histone）- DNA 互作
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技術(shù)服務(wù)描述
ATAC-seq 技術(shù)用到了一個(gè)轉座酶 Tn5：DNA 轉座是一種由 DNA 轉座酶介導，把 DNA 序列從染色體的一個(gè)區域插入到另外一個(gè)區域的現象，類(lèi)似于“剪切粘貼”。這個(gè)過(guò)程，也是需要插入位點(diǎn)的染色質(zhì)是開(kāi)放的，否則就會(huì )被一大坨高級結構給卡住。
轉座酶可以隨機結合并切割染色質(zhì)開(kāi)放區的 DNA，并且可同時(shí)在切割位點(diǎn)插入接頭序列。只要將攜帶已知 DNA 序列標簽的轉座復合物（即帶紅色和藍色序列標簽的 Tn5 轉座酶）加入到細胞核中一起孵育，再利用已知序列標簽進(jìn)行 PCR 擴增即可形成文庫，經(jīng)過(guò)測序就可以獲得染色質(zhì)開(kāi)放區的信息。
服務(wù)優(yōu)勢：
細胞用量少
實(shí)驗周期短，1-2天可完成
實(shí)驗結果重復性高
可同時(shí)檢測轉錄因子與核小體的定位
客戶(hù)提供：
每個(gè)樣本50000 個(gè)細胞
至少兩組樣品，對照組與實(shí)驗組
賽誠提供：
原始數據raw data
數據質(zhì)控結果：raw data-fastqc、clean data-fastqc
call peak 結果文件：bam文件.excel文件.bw文件(IGV可打開(kāi)文件）
可按客戶(hù)要求進(jìn)行定制化分析